MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009468	CGAC	2	8	82267	82274	25 %	0 %	25 %	50 %	148243880
1502	NC_009468	GCGG	2	8	82346	82353	0 %	0 %	75 %	25 %	148243880
1503	NC_009468	TGG	2	6	82432	82437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243880
1504	NC_009468	GCC	2	6	82452	82457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243880
1505	NC_009468	CGA	2	6	82466	82471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1506	NC_009468	GAC	2	6	82487	82492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1507	NC_009468	TCG	2	6	82558	82563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1508	NC_009468	GGC	2	6	82565	82570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243880
1509	NC_009468	GGC	2	6	82611	82616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243880
1510	NC_009468	CCA	2	6	82660	82665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243880
1511	NC_009468	ATC	2	6	82722	82727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243880
1512	NC_009468	CGA	2	6	82730	82735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1513	NC_009468	TGC	2	6	82783	82788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1514	NC_009468	ATG	2	6	82794	82799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243880
1515	NC_009468	CTGG	2	8	82868	82875	0 %	25 %	50 %	25 %	148243880
1516	NC_009468	GCC	2	6	82901	82906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243880
1517	NC_009468	GCT	2	6	82985	82990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243880
1518	NC_009468	GAT	2	6	83027	83032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243880
1519	NC_009468	TCCG	2	8	83088	83095	0 %	25 %	25 %	50 %	148243880
1520	NC_009468	CAGC	2	8	83143	83150	25 %	0 %	25 %	50 %	148243880
1521	NC_009468	CGC	2	6	83353	83358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243881
1522	NC_009468	AGA	2	6	83359	83364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243881
1523	NC_009468	CGG	2	6	83407	83412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243881
1524	NC_009468	GC	3	6	83435	83440	0 %	0 %	50 %	50 %	148243881
1525	NC_009468	TGG	2	6	83485	83490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243881
1526	NC_009468	CATG	2	8	83600	83607	25 %	25 %	25 %	25 %	148243881
1527	NC_009468	CAAT	2	8	83700	83707	50 %	25 %	0 %	25 %	148243882
1528	NC_009468	CGG	2	6	83755	83760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243882
1529	NC_009468	ACG	2	6	83871	83876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243882
1530	NC_009468	GATGA	2	10	83969	83978	40 %	20 %	40 %	0 %	148243882
1531	NC_009468	GC	3	6	84039	84044	0 %	0 %	50 %	50 %	148243882
1532	NC_009468	TCA	2	6	84113	84118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243882
1533	NC_009468	TTGA	2	8	84137	84144	25 %	50 %	25 %	0 %	148243882
1534	NC_009468	GCA	2	6	84205	84210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1535	NC_009468	CGG	2	6	84418	84423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243883
1536	NC_009468	GC	3	6	84473	84478	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1537	NC_009468	GAG	2	6	84479	84484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243883
1538	NC_009468	TGGT	2	8	84519	84526	0 %	50 %	50 %	0 %	148243883
1539	NC_009468	GTCC	2	8	84528	84535	0 %	25 %	25 %	50 %	148243883
1540	NC_009468	CCA	2	6	84563	84568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243883
1541	NC_009468	CCG	2	6	84598	84603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1542	NC_009468	GCT	2	6	84625	84630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1543	NC_009468	TGC	2	6	84642	84647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1544	NC_009468	TCC	2	6	84696	84701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243883
1545	NC_009468	CTT	2	6	84752	84757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243883
1546	NC_009468	GCC	2	6	84771	84776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1547	NC_009468	CCGCG	2	10	84824	84833	0 %	0 %	40 %	60 %	148243883
1548	NC_009468	GAG	2	6	84884	84889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243883
1549	NC_009468	CGC	2	6	84906	84911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1550	NC_009468	GGTC	2	8	84913	84920	0 %	25 %	50 %	25 %	148243883
1551	NC_009468	CGA	2	6	84937	84942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1552	NC_009468	GCC	3	9	85135	85143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1553	NC_009468	CCGG	2	8	85165	85172	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1554	NC_009468	G	6	6	85186	85191	0 %	0 %	100 %	0 %	148243883
1555	NC_009468	CCGG	2	8	85197	85204	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1556	NC_009468	GC	3	6	85284	85289	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1557	NC_009468	TGT	2	6	85306	85311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243883
1558	NC_009468	GCC	2	6	85326	85331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1559	NC_009468	GC	3	6	85366	85371	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1560	NC_009468	CGT	2	6	85372	85377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1561	NC_009468	GGCGC	2	10	85409	85418	0 %	0 %	60 %	40 %	148243883
1562	NC_009468	GAT	2	6	85442	85447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243883
1563	NC_009468	GGC	2	6	85450	85455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243883
1564	NC_009468	CGA	2	6	85456	85461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1565	NC_009468	GCA	2	6	85488	85493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1566	NC_009468	TCG	2	6	85504	85509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1567	NC_009468	GCCG	2	8	85514	85521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1568	NC_009468	GCCG	2	8	85555	85562	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1569	NC_009468	CAG	2	6	85577	85582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1570	NC_009468	GCCC	2	8	85599	85606	0 %	0 %	25 %	75 %	148243883
1571	NC_009468	GTC	2	6	85616	85621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1572	NC_009468	AGC	2	6	85629	85634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1573	NC_009468	TTGCC	2	10	85641	85650	0 %	40 %	20 %	40 %	148243883
1574	NC_009468	ATC	2	6	85737	85742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243883
1575	NC_009468	GAT	2	6	85832	85837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243883
1576	NC_009468	GAA	2	6	85964	85969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243883
1577	NC_009468	ATG	2	6	86013	86018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243883
1578	NC_009468	TTC	2	6	86052	86057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243883
1579	NC_009468	GC	3	6	86139	86144	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1580	NC_009468	TGC	2	6	86154	86159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1581	NC_009468	CTT	2	6	86222	86227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243883
1582	NC_009468	CG	3	6	86255	86260	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1583	NC_009468	GC	3	6	86266	86271	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1584	NC_009468	CGA	2	6	86419	86424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1585	NC_009468	CAG	2	6	86468	86473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1586	NC_009468	GGGAA	2	10	86481	86490	40 %	0 %	60 %	0 %	148243883
1587	NC_009468	CCG	2	6	86512	86517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243883
1588	NC_009468	CG	4	8	86530	86537	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1589	NC_009468	GC	3	6	86549	86554	0 %	0 %	50 %	50 %	148243883
1590	NC_009468	TCG	2	6	86598	86603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1591	NC_009468	CAG	2	6	86666	86671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1592	NC_009468	TCA	2	6	86710	86715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243883
1593	NC_009468	CGGT	2	8	86749	86756	0 %	25 %	50 %	25 %	148243883
1594	NC_009468	CGT	2	6	86792	86797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1595	NC_009468	CTG	2	6	86823	86828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243883
1596	NC_009468	AT	4	8	86856	86863	50 %	50 %	0 %	0 %	148243883
1597	NC_009468	ACA	2	6	87270	87275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243884
1598	NC_009468	CGA	2	6	87353	87358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243884
1599	NC_009468	GAA	2	6	87361	87366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243884
1600	NC_009468	CAC	2	6	87381	87386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243884
1601	NC_009468	C	6	6	87389	87394	0 %	0 %	0 %	100 %	148243884
1602	NC_009468	CG	3	6	87472	87477	0 %	0 %	50 %	50 %	148243884
1603	NC_009468	GGCATT	2	12	87478	87489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243884
1604	NC_009468	GCT	2	6	87509	87514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243884
1605	NC_009468	TAATG	2	10	87864	87873	40 %	40 %	20 %	0 %	148243885
1606	NC_009468	CGC	2	6	88029	88034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243885
1607	NC_009468	GCG	2	6	88092	88097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243885
1608	NC_009468	CTG	2	6	88167	88172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243886
1609	NC_009468	GCTG	2	8	88225	88232	0 %	25 %	50 %	25 %	148243886
1610	NC_009468	TCAC	2	8	88257	88264	25 %	25 %	0 %	50 %	148243886
1611	NC_009468	GCC	2	6	88276	88281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243886
1612	NC_009468	TCA	2	6	88300	88305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243886
1613	NC_009468	TGGC	2	8	88311	88318	0 %	25 %	50 %	25 %	148243886
1614	NC_009468	CTG	2	6	88323	88328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243886
1615	NC_009468	CCT	2	6	88394	88399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243886
1616	NC_009468	GTC	2	6	88404	88409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243886
1617	NC_009468	GCCG	2	8	88525	88532	0 %	0 %	50 %	50 %	148243886
1618	NC_009468	GC	3	6	88573	88578	0 %	0 %	50 %	50 %	148243886
1619	NC_009468	CGT	2	6	88592	88597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243886
1620	NC_009468	CAT	2	6	88649	88654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243886
1621	NC_009468	CAA	2	6	88661	88666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243886
1622	NC_009468	ACG	2	6	88718	88723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243886
1623	NC_009468	CAC	2	6	88748	88753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243886
1624	NC_009468	TCT	2	6	88778	88783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243886
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1626	NC_009468	GC	3	6	88956	88961	0 %	0 %	50 %	50 %	148243886
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1876	NC_009468	CGT	2	6	104009	104014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243897
1877	NC_009468	TGT	2	6	104277	104282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243898
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1880	NC_009468	GCC	2	6	104359	104364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243898
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1883	NC_009468	GGC	2	6	104557	104562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243898
1884	NC_009468	CCTCGA	2	12	104574	104585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243898
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1888	NC_009468	CGTT	2	8	104917	104924	0 %	50 %	25 %	25 %	148243899
1889	NC_009468	CGA	2	6	104937	104942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243899
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1968	NC_009468	ACA	2	6	110504	110509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243902
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1986	NC_009468	CA	3	6	111184	111189	50 %	0 %	0 %	50 %	148243902
1987	NC_009468	ATC	2	6	111244	111249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243902
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1991	NC_009468	TGGCG	2	10	111456	111465	0 %	20 %	60 %	20 %	148243902
1992	NC_009468	CGC	2	6	111483	111488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243902
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1994	NC_009468	CCG	2	6	111543	111548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243902
1995	NC_009468	AGCC	2	8	111563	111570	25 %	0 %	25 %	50 %	148243902
1996	NC_009468	CAA	2	6	111653	111658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243902
1997	NC_009468	GGC	2	6	111705	111710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243903
1998	NC_009468	AGGC	2	8	111729	111736	25 %	0 %	50 %	25 %	148243903
1999	NC_009468	CGA	2	6	111791	111796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243903
2000	NC_009468	CGT	2	6	111893	111898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243903

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